二者適用對象不同。商標是用于區別商品或服務的標識，使用在相同或相似的商品或服務上，并只能用于特定的商品或服務上。如我國商標法規定，注冊商標專用權，以核準注冊的商標和核定使用的商品為限。域名是用于解決IP地址對應的一種方法，是為了方便人們使用因特網而創設的，它并不直接與商品或服務相聯系，且不能離開因特網而獨立存在。

二者具有的標識性與排他性的基礎不同。商標的相互區別性與排他性是以商品或服務的相同或相似為基礎的，不同的商品或服務通常不會產生這種要求(馳名商標除外)；

因此，同一國家或不同國家的不同法律主體就相同商標分別享有相互獨立的權利是常見的現象。

而域名則具有全球范圍內的絕對唯一性，不因法律主體、商品或服務種類、國家或地區的不同而有任何區別，不存在不同國家的法律主體就相同域名分別主張權利的可能性。此種唯一性是其絕對的排他性的基礎，并由因特網上域名系統的技術性特征所決定。

二者取得的原則不同。商標取得的原則主要有三種：

(1)注冊在先原則

(2)使用在先原則

(3)前二者的折衷

不同的國家或地區可能采用不同的原則。而域名的注冊則采注冊在先原則，先申請、先注冊，不注冊就不能在因特網上使用，此原則為各國所普遍遵循。同時，商標的注冊機構在注冊時通常負有檢索責任，而域名的注冊機構則不負檢索責任。

二者的顯著性要求不同。商標的構成以具有普通人主觀上能夠判斷的顯著性為前提，否則難以起到區分商品或服務來源的功能；而域名構成的顯著性要求明顯低于商標，任何形式的不完全相同或任何程度的相似、只要計算機能夠識別即均可注冊為獨立的域名。

域名的全球唯一性等特征決定了其商業影響的全球性，域名一經有效注冊并投入使用，世界上的任何人、在任何地點或時間都可能在網上點擊到該域名，并由此進入注冊該域名的廠商網站，從而可能給其注冊人帶來可觀的商業利益。

也正因如此，實踐中，一方面，企業通常將自己知名度較高的商標或商號注冊為域名，使域名成為商標或商號在互聯網上的延伸；另一方面，域名注冊人又往往會將其知名度較高的域名申請注冊為商標或商號。

前者可稱為商標、商號的域名化現象，后者則可稱為域名的商標、商號化現象。對于前者，只要不存在注冊在先的相同域名，申請人的目的很容易實現；而對于后者，情況卻要復雜得多。

以域名的商標化為例，域名注冊人若想使其域名發展成為商標，必須在域名設計階段及域名注冊后實施適當的步驟，如域名構成本身必須符合法律并具備商標法所要求的顯著性，域名的注冊與使用須不侵犯他人的在先權利，域名所有人須有依法將域名用作商標的使用行為等。